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詳細介紹
一、產品概述
牛津納米孔技術®的納米孔三代測序儀GridION™ Mk1是一款緊湊型臺式測序系統。它允許最多五個測序實驗同時或單獨進行。你可以選擇一次性使用這部分資源的多寡。GridION Mk1還允許您將納米孔測序作為服務提供。
GridION Mk1 擁有五個測序端口，可連接 MinION/GridION 流單元或帶流單元的 Flongle 適配器，同時配備高性能集成計算機和基調加速器。該設備可以實時調用由五個流單元/Flongle生成的數據。當前的化學和軟件支持在GridION Mk1運行期間生成多達150 Gbase的數據。
搭建GridION Mk1所需的基礎設施極少，無需升級設施。新設備只需電源和通過以太網端口的網絡連接。外設（如鍵盤和鼠標）提供三個USB 3.0接口。顯示器必須通過isplayPort連接。設備通過C13線從市電供電，開機時通過前面板的電源按鈕。
二、核心技術
Oxford Nanopore 測序基于納米孔單分子檢測技術。測序時，核酸分子（DNA/RNA）在馬達酶驅動下，以單鏈形式逐個堿基穿過納米孔。當堿基通過時，會改變納米孔內的電流強度，不同堿基（A、T、C、G）及修飾堿基對應的電流信號存在差異。設備實時捕獲這些電流變化，經 MinKNOW™等軟件轉化為堿基序列，實現單分子直接測序。該技術無需 PCR 擴增，可保留堿基修飾信息，且讀長不受限，能實現實時數據分析，兼具便攜性與高效性。
三、設備性能優勢
1. 靈活性：納米孔三代測序儀GridION™ Mk1可同時運行多達 5 個獨立的 MinION Flow Cell，支持分樣本并行測序或單樣本多通道疊加，靈活適配多樣本處理或提升數據深度的需求，大幅提高實驗效率。
2. 實時數據獲取：能即時生成測序數據，無需等待完整測序流程結束，助力快速獲取可落地的分析見解，尤其適用于應急檢測等對時效要求高的場景。
3. 集成計算能力：內置強大計算模塊，可直接進行實時數據分析，無需依賴復雜的外部 IT 基礎設施，降低設備部署門檻，簡化實驗操作流程。
4. 緊湊小巧設計：設備占地面積小，采用桌面式布局，節省實驗室空間，適配各類實驗室環境，無需為放置設備單獨規劃大面積區域。
5. 無限制讀長：可對短片段到超長片段的任意長度核酸分子進行測序，不受片段長度限制，能高效解析基因組復雜結構變異等難題，突破傳統短讀長測序局限。
四、適用應用
1. 細菌宏基因組學：5 個獨立 Flow Cell 可并行處理樣本，結合超長讀長，精準解析菌群結構與功能基因，48GB / 通道數據滿足復雜菌群多樣性研究。
2. 細菌分離株：單通道高數據輸出保障分離株基因組高覆蓋度，快速完成組裝與注釋，助力耐藥基因、毒力因子等關鍵信息解析。
3. 細菌全基因組：無需 PCR 擴增減少測序偏好，超長讀長高效解決基因組重復序列難題，為細菌進化溯源、分子分型提供高質量數據。
4. 病毒擴增子：實時數據輸出快速識別病毒變異，多通道并行可同時檢測多種病毒擴增子，提升病毒變異監測與流行病學調查效率。
5. 全長 16S rRNA：覆蓋 16S rRNA 全長序列，避免短讀長分類模糊問題，多通道支持大量樣本并行，實現菌株水平精準鑒定。
6. 全外顯子組：高數據量滿足外顯子區域深度測序需求，超長讀長精準檢測插入缺失等復雜變異，為遺傳病、腫瘤相關研究提供關鍵數據。
7. 全轉錄組（cDNA）：無需拼接即可獲取全長 cDNA 序列，清晰區分可變剪切亞型，多通道并行提升低豐度轉錄本檢測效率。
8. 較小的轉錄組（直接 RNA）：直接 RNA 測序保留堿基修飾信息，超長讀長獲完整轉錄本序列，適配病毒、低等生物小轉錄組研究，快速解析轉錄動態。
五、適配試劑與軟件
Flow Cell 兼容性：支持 MinION 系列所有 Flow Cell（如 R9.4.1、R10.4），包括 DNA 專用、RNA 專用及修飾檢測專用型號；
軟件生態：標配 MinKNOW™（數據采集）、Guppy（堿基識別）、Minimap2（序列比對），可兼容第三方分析工具（如 Nanoplot、Flye）。
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